Proteinler, peptitleri oluşturmak için bir araya getirilen amino asitlerden oluşturulan biyolojik polimerlerdir. Bu peptit alt birimleri, daha karmaşık yapılar oluşturmak için diğer peptitlerle bağlanabilir. Birden çok kimyasal bağ türü proteinleri bir arada tutar ve diğer moleküllere bağlar. Şuna daha yakından bakın Kimyasal bağlar protein yapısından sorumlu.
Bir proteinin birincil yapısı aşağıdakilerden oluşur: amino asitler birbirlerine zincirleme. Amino asitler peptit bağları ile birleştirilir. Bir peptit bağı, bir amino asidin karboksil grubu ile başka bir amino asidin amino grubu arasındaki bir tür kovalent bağdır. Amino asitlerin kendileri kovalent bağlarla birleştirilen atomlardan yapılır.
İkincil yapı, bir amino asit zincirinin (örneğin, beta-kıvrımlı tabaka, alfa sarmalı) üç boyutlu katlanmasını veya sarılmasını tanımlar. Bu üç boyutlu şekil, hidrojen bağları. Bir hidrojen bağı, bir hidrojen atomu ile azot veya oksijen gibi bir elektronegatif atom arasındaki bir dipol-dipol etkileşimidir. Tek bir polipeptit zinciri, birden çok alfa-sarmal ve beta-kıvrımlı tabaka bölgesi içerebilir.
Her alfa-sarmal, aynı polipeptit zinciri üzerinde amin ve karbonil grupları arasında hidrojen bağı ile stabilize edilir. Beta-kıvrımlı tabaka, bir polipeptit zincirinin amin grupları ile ikinci bir bitişik zincir üzerindeki karbonil grupları arasındaki hidrojen bağları ile stabilize edilir.
İkincil yapı uzayda amino asit zincirlerinin şeklini açıklarken, üçüncül yapı "Molekül" terimi, her iki tabakanın bölgelerini de içerebilen tüm molekül tarafından kabul edilen genel şekildir ve bobinleri. Bir protein bir polipeptit zincirinden oluşuyorsa, üçüncül bir yapı en yüksek yapı düzeyidir. Hidrojen bağı bir proteinin üçüncül yapısını etkiler. Ayrıca, her amino asidin R-grubu hidrofobik veya hidrofilik olabilir.
Bazı proteinler, protein moleküller daha büyük bir birim oluşturmak için birbirine bağlanır. Böyle bir proteinin bir örneği hemoglobindir. Kuaterner yapı, alt birimlerin daha büyük molekülü oluşturmak için nasıl bir araya geldiğini açıklar.