Mezensefalonda tektum, tegmentum, serebral peduncle, substantia nigra, crus cerebri ve kranial sinirler (okülomotor ve troklear). tectum görme ve işitme süreçlerinde yer alan kolikuli adı verilen yuvarlak çıkıntılardan oluşur. beyin sapı ön beyin ve arka beyni bağlayan bir sinir lifleri demetidir. Serebral pedinkül şunları içerir: tegementum (orta beynin tabanını oluşturur) ve kabuk serebri ( beyin ile beyincik). substantia nigra ile sinir bağlantıları vardır ön loblar ve beynin motor fonksiyonda yer alan diğer alanları. Substantia nigra hücreleri de koordine yardımcı kimyasal bir haberci dopamin üretmek kas hareketi.
Nörodejenerasyonu sinir hücreleri substantia nigra'da dopamin üretiminin düşmesi ile sonuçlanır. Dopamin düzeylerinde (% 60-80) önemli kayıp, Parkinson hastalığının gelişmesine neden olabilir. Parkinson hastalığı gergin sistem motor kontrol ve koordinasyon kaybıyla sonuçlanan bozukluk. Semptomlar titreme, hareket yavaşlığı, kas sertliği ve denge sorunudur.