Felaket selleri Sarı Nehir mahsulleri yıkadı, köylüleri boğdu ve nehrin rotasını değiştirdi, böylece artık Büyük Kanal ile karşılaşmadı. Bu felaketlerin aç kurtulanları, etnik Moğol hükümdarlarının Yuan Hanedanlığı, kaybetmişti Cennetin Görevi. Aynı yöneticiler Han Çinli deneklerinin 150.000 ila 200.000 kadarını, bir kez daha kanalı kazıp nehre katmak için büyük bir işgücü koluna çıkmaya zorladığında, işçiler isyan etti. Kızıl Türban İsyanı olarak adlandırılan bu ayaklanma, Moğol yönetiminin Çin üzerindeki sonunun başlangıcına işaret etti.
Kızıl Türbanların ilk lideri Han Shantong, takipçilerini 1351'de kanal yatağını kazdıran zorunlu işçilerden işe aldı. Han'ın büyükbabası, Kızıl Türban İsyanı için dini destek sağlayan Beyaz Lotus tarikatının mezhep lideriydi. Yuan Hanedanlığı yetkilileri kısa süre sonra Han Shantong'u yakaladı ve idam etti, ancak oğlu isyanın başında yerini aldı. Her iki Hans da takipçilerinin açlığı, çalışmaya zorlanma konusundaki memnuniyetsizlikleri ile oynayabildi hükümet için para ödemeden ve onların "barbarlar" tarafından Moğolistan. Kuzey Çin'de bu, Kızıl Türban hükümet karşıtı faaliyetlerin patlamasına yol açtı.
Bu arada, güney Çin'de, Xu Shouhui önderliğinde ikinci bir Kızıl Türban ayaklanması başladı. Kuzey Kızıl Türbanları ile benzer şikayetleri ve hedefleri vardı, ancak ikisi hiçbir şekilde koordine edilmedi.
Köylü askerleri başlangıçta beyaz renkle (Beyaz Lotus Topluluğu'ndan) tanımlanmasına rağmen, çok daha şanslı kırmızıya dönüştüler. Kendilerini tanımlamak için kırmızı kafa bantları giydiler veya hong jinayaklanmaya "Kızıl Türban İsyanı" adı verildi. Geçici silahlar ve çiftlik aletleri ile donatılmış, merkezi hükümetin Moğol liderliğindeki orduları için gerçek bir tehdit olmamalılardı, ama Yuan Hanedanlığı kargaşa.
Başlangıçta Baş Meclis Üyesi Toghto adlı yetenekli bir komutan, Kuzey Kızıl Türbanları indirmek için 100.000 emperyal askerin etkili bir gücünü bir araya getirebildi. 1352'de Han'ın ordusunu yönlendirerek başarılı oldu. 1354'te Kızıl Türbanlar bir kez daha saldırıya geçti ve Büyük Kanal'ı kesti. Toghto, geleneksel olarak 1 milyonda bir güç topladı, ancak şüphesiz bu büyük bir abartı. Tıpkı Kızıl Türbanlara karşı harekete geçmeye başladığında, mahkeme entrikaları imparatorun Toghto'yu görevden almasına neden oldu. Öfkeli subayları ve askerlerin birçoğu, kaldırılmasını protesto etmek için terk etti ve Yuan mahkemesi, Kızıl Türban karşıtı çabalara öncülük etmek için hiçbir zaman etkili bir general bulamadı.
1350'lerin sonları ve 1360'ların başlarında, Kızıl Türbanların yerel liderleri askerlerin ve bölgelerin kontrolü için kendi aralarında savaştılar. Birbirlerine o kadar fazla enerji harcadılar ki Yuan hükümeti bir süre göreceli olarak barış içinde kaldı. Sanki isyan, farklı savaş ağalarının tutkusunun ağırlığı altında çökebilirmiş gibi görünüyordu.
Ancak, Han Shantong'un oğlu 1366'da öldü; bazı tarihçiler generali Zhu Yuanzhang'ın boğulduğuna inanıyor. İki yıl daha sürmesine rağmen, Zhu, köylü ordusunu 1368'de Dadu'daki (Pekin) Moğol başkentini ele geçirmeye yönlendirdi. Yuan Hanedanlığı düştü ve Zhu, etnik olarak yeni bir Han kurdu Çince Hanedan Ming dedi.